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    2018-11

    精科在ICG-13同期衛星會(huì )分享MGISEQ-2000在遺傳性疾病檢測中的應用
    發(fā)布時(shí)間:2018-11-30 17:08:42作者:精科醫學(xué) 來(lái)源:精科醫學(xué)

    2018年10月25日ICG-13期間,廣州精科醫學(xué)檢驗所有限公司蔣馥蔓技術(shù)總監在基因組學(xué)技術(shù)與應用研討會(huì ) (TACG)上與大家分享了MGISEQ-2000在遺傳性疾病檢測中的應用案例。蔣總監在分享中,重點(diǎn)介紹了基于外顯子捕獲探針和MGISEQ-2000測序平臺的WES數據表現,以及WES在臨床疾病診斷中的應用。

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    在衛星會(huì )上,蔣總監分享了兩例全外顯子測序診斷遺傳病的案例。在案例中,蔣總監分別展示了MGISEQ-2000及同類(lèi)產(chǎn)品的測序數據,從數據質(zhì)量,到檢出結果,MGISEQ-2000的表現與同類(lèi)產(chǎn)品相當。

    案例1:男性,1歲半,臨床癥狀為生長(cháng)異常, 運動(dòng)功能障礙,免疫力低下,脊柱側彎。

    蔣總監介紹到,團隊分別使用華大智造測序儀MGISEQ-2000及外顯子捕獲探針MGI Exome V4與Novaseq及IDT xGen Exome Research pannel對受檢者的全外顯子組基因進(jìn)行了檢測和分析,華大智造測序平臺與同類(lèi)平臺測序數據表現相當,且最終檢出結果一致(圖1、圖2)。

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    通過(guò)全外顯子基因測序,檢測到ERCC6基因兩個(gè)雜合變異c.3627dupT (p.K1210*)和c.1297G>T (p.E433*),根據送檢者父母檢測數據顯示這兩個(gè)變異分別來(lái)自受檢者的父親和母親,這兩個(gè)變異均為“Ⅰ類(lèi)-致病突變”(圖)。ERCC6基因相關(guān)疾病為科凱恩綜合征,呈常染色體隱性遺傳,臨床表現通常為生長(cháng)發(fā)育遲緩,中樞和周?chē)窠?jīng)系統功能受損,先天性白內障,關(guān)節和脊椎產(chǎn)后攣縮。

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    案例2:男性,6個(gè)月,患有肺炎,腹股溝兩側淋巴腫大、低熱不退、腹瀉、濕疹等癥狀。其出生時(shí)輸入卡介疫苗后出現發(fā)熱、肺結核癥狀,以后經(jīng)常出現發(fā)熱癥狀。

    同樣,精科生物團隊對2號檢測者也分別通過(guò)測序儀MGISEQ-2000平臺及MGI Exome V4與NovaSeq及Agilent V6進(jìn)行了外顯子測序和分析,最終檢出結果一致(圖4、圖5)。

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    結果顯示,檢測者CYBB基因有一個(gè)半合變異c.388C>T (p.R130*)。這個(gè)p.R130*變異為無(wú)義突變,預測可導致蛋白質(zhì)合成提前終止,為“Ⅰ類(lèi)-致病突變” (圖6)。CYBB基因相關(guān)疾病為慢性肉芽腫病,呈性染色體連鎖遺傳。臨床表現通腸胃感染和肉芽腫病變,累及肺、淋巴結、肝和皮膚,包括肺炎、膿腫、淋巴結炎、骨髓炎和蜂窩組織炎。

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    在分享會(huì )上,蔣總監同時(shí)對外展示了DiHap方法的無(wú)創(chuàng )產(chǎn)前β-地貧基因檢測新技術(shù),該技術(shù)通過(guò)靶向技術(shù)檢測目標熱點(diǎn)區域的DNA,并可通過(guò)長(cháng)片段測序,直接構建父母基因單倍體型,無(wú)需先證者或家族其他成員的遺傳信息,在RHDO策略的基礎上, 保留了對胎兒基因組的全面檢測,具有對檢測深度要求不高的特點(diǎn)。

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